Modeltest es un programa diseñado por David Posada para determinar que modelo evolutivo se ajusta mejor a nuestro conjunto de datos de secuencias de ADN o proteínas. Recientemente ha salido una nueva versión en java de este programa, llamada jMODELTEST. Hace unos días probé la nueva versión, en Linux (Ubuntu), y tengo que deciros que por ahora me ha ido bastante bien con ella. Tiene un interfaz gráfico bastante intuitivo, una buena documentación, y el programa es bastante rápido.

Con este programa podemos saber que modelo evolutivo se ajusta mejor a nuestros datos, para después construir nuestra filogenia con otros programas. En el laboratorio de David Posada no solo han desarrollado este programa, sino bastantes más como: TREESCAN, PROTTEST (en cuyo desarrollo participó Federico Abascal, antiguo alumno del Master en Bioinformática y Biología Computacional), GEODIS, COLLAPSE etc. Sus intereses se centran en: filogeografía, filogenética, evolución de virus, bioinformática y modelos de evolución molecular. Os pongo un enlace a su página web.