Según se explica en la presentación del proyecto ACGT, la finalización del proyecto del genoma humano ha dado lugar al desarrollo de nuevas herramientas para ayudar al investigador en biomedicina en el descubrimiento de los mecanismos que rigen las enfermedades. Mientras que el objetivo está claro, el camino ha estado lleno de obstáculos debido a los desafíos técnicos, científicos y sociológicos.

ACGT incluye reconocidos líderes internacionales en sus respectivos campos, con el objetivo de proporcionar a la comunidad científica dedicada a la investigación en cáncer un entorno clínico-genómico integrado, desarrollado sobre una potente infraestructura GRID.

Para la consecución de este objetivo, ACGT ha formulado un plan de trabajo coherente e integrado para el diseño, desarrollo, integración y validación de todas estas áreas de trabajo de interés tecnológico.

Estas áreas de trabajo son:

1. GRID: desarrollo de una infraestructura GRID Biomédica Europea que ofrezca servicios de mediación semántica transparentes para el intercambio de datos, métodos y herramientas de procesos de datos y seguridad avanzada.
2. Integración: integración semántica de datos clínicos, genómicos y proteómicos basada en ontologías, teniendo en cuenta ontologías y metadatos estándar
3. Descubrimiento del conocimiento: Creación de servicios GRID de data-mining para mantener y mejorar procesos complejos de descubrimientos de conocimiento
4. Mejorar los procesos de ensayos clínico en el marco de la medicina genómica para el desarrollo de nuevos medicamentos.

La plataforma tecnológica será validada en un marco concreto de ensayo clínico de cáncer. Se han seleccionado ensayos pilotos basados en la presencia de claros objetivos de investigación, aumentando la necesidad de integrar datos a todos los niveles del ser humano.

ACGT impulsa un origen y un acceso abierto, permitiendo una creación gradual de un GRID Biomédico Europeo del Cáncer. De ahí que el proyecto planee introducir ensayos clínicos adicionales durante su ciclo de vida. Esto está en línea con las prioridades de la UE y los objetivos del programa de IST.

La actividad de la Facultad de informática de la UPM consiste en:

1. Coordinación de las tareas de creación de interoperabilidad de sistemas e integración de datos clínico-genómicos.
2. Desarrollo de nuevos modelos de minería de datos basados en Grid
3. Diseño de servicios Grid para la recuperación de información y tareas implicadas en los ensayos clínico-genómicos
4. Implementación de un mediador semántico en el área de Gris para su uso en ensayos clínicos


RESPONSABLE TÉCNICO:

Nombre y apellidos: Victor Manuel Maojo García
Departamento: Inteligencia Artificial
Centro: Facultad de Informática
Dirección:
Campus de Montegancedo s/n - 28660 Madrid
Tel: +34 91 3366897 / Fax: +34 91 3524819
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